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フォルダ名にルールがあるのであればfor文を使う形で対応できると思います。
for i = 1 to 2
Load
FROM [lib://a /Downloads/$(i)/*.csv] (txt, codepage is 932, embedded labels, delimiter is ',', msq);
next i;
今回は$(i)でフォルダ名を１、２というような形で定義していますが
フォルダリストを取り込んでそのリストを使ってfor文でLoadすることも可能です。
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