Olá,
É interessante seu relato, pois geralmente a extração pelo QVD é mais rápida. Talvez a indexação da sua consulta SQL pode ter o resultado mais rápido, no momento, em comparação ao oriundo dos arquivos QVDs.
Entretanto na documentação da Qlik (
https://help.qlik.com/pt-BR/sense/June2019/Subsystems/Hub/Content/Sense_Hub/Scripting/work-with-QVD-...) é destacado que " A leitura de dados de um arquivo QVD é geralmente de 10 a 100 vezes mais rápida do que a leitura de outras fontes de dados."
Todavia, para melhor governança e gerenciamento dos projetos Qlik, inclusive pensando no crescimento do volume de dados, a boa prática é usar QVD.
Veja este material
http://www.qlikisrael-support.com/Knowledgebase/Article/GetAttachment/164/2093991Ezir